De første mennesker som satte deres fod i Qooqqut, var Saqqaq kulturen for 4500 år siden, hvor de boede faktisk kun om sommeren, hvis de overhovedet kom der, i det der skulle være rensdyr før at der var nogen ide i at komme forbi i det område.

Der er ikke fundet effekter fra denne tidsperiode i Qooqqut, men Itinnera ca. 30 km. Borte er udpeget til at være en vigtig lokalitet for Saqqaqfolket.

Saqqaq folket rådet over en tidligt form for kajak, og holdt hunde som husdyr men ikke som slæde trækdyr, og har som det eneste folkeslag været i stand til at overleve i Grønland i ikke mindre end 1600 år. En bedrift som ikke er slået siden (Vi arbejder på sagen)

De kogte deres mad ved at plumpe varme sten ned i skindposer med vand og kød, og man kendte til brug af spæklampen, og de forsynede lige deres boliger med et flisegulv

Saqqaq folket enten udvandrede, uddøde eller  eller blandede sig med  Dorset 1 for mellem 2.900 og 2.600 år siden